Původně na případ půlmilionového úplatku pro Jiřího Čunka dohlíželo Okresní státní zastupitelství (OSZ) ve Vsetíně. Podle Krajského státního zastupitelství v Ostravě, pobočka Olomouc, však měl mít Čunek blízké vztahy ke státním zástupcům ze Vsetína a případ tak delegovalo do Přerova. 8. února 2007 pak bylo zahájeno trestní stíhání Jiřího Čunka pro přijímání úplatku, proti kterému podal Čunek stížnost. Tu OSZ v Přerově 27. února 2007 zamítlo.

Po zahájení trestního řízení ale nemělo OSZ v Přerově právo stížnost zamítnout, takže jeho postup byl protizákonný. Bylo totiž delegováno jen pro úsek prověřování případu, který skončil ve chvíli zahájení trestního stíhání. Veškeré další kroky už tak nemělo OSZ v Přerově provádět. Nejvyšší soud proto zamítnutí stížnosti proti zahájení trestního stíhání zrušil. Výsledek kauzy to ale neovlivní, protože jihlavský státní zástupce Arif Salichov stíhání Čunka zastavil s tím, že je nepochybné, že skutky, pro které se stíhání vede, se nestaly.

Nejvyšší státní zastupitelství se prostřednictvím svého zástupce Stanislava Potoczka. přiklonilo ke stížnosti ministryně spravedlnosti. „Usnesení OSZ v Přerově hodnotíme jako rozhodnutí zmatečné. Vykonával je místně nepříslušný státní zástupce,“ upřesnil Potoczek. Doufá také, že je to definitivní tečka za celým případem.

Obhájce Jiřího Čunka Radek Závodný před soudem uvedl, že v celé kauze je více nestandardních kroků a hovořil dokonce o severomoravské justiční mafii, jejímž cílem bylo odstranit populárního senátora z politické scény. "Tak jak ho znám, tuhle věc nenechá jenom tak a nějaké právní kroky bude činit," odpověděl Závodný na otázku, jak bude Jiří Čunek dále postupovat, když státní zástupci porušili zákon.

Jiří Čunek ani zástupci ministerstva se jednání nezúčastnili.